Le cancer du sein est une maladie hétérogène avec de multiples sous-types biologiques, moléculaires et histologiques. Dans un tel contexte, la métabolomique constitue une démarche prometteuse puisqu'elle se rapproche le plus possible du phénotype du patient, ouvrant la voie vers l'identification de biomarqueurs signatures et par conséquent vers une meilleure stratification des patients. L'étude des métabolites dans le cancer du sein pourrait en effet permettre de comprendre comment un métabolisme défectueux peut déclencher les processus cancéreux et les altérations du métabolome pourraient également être utilisées comme indicateurs potentiels de l'agressivité du cancer. Selon les auteurs de la présente étude, il n'existe aucune publication faisant état de travaux permettant de spécifiquement distinguer par métabolomique des tumeurs du sein de haut grade.
Dans cette étude, les chercheurs ont effectué une analyse métabolomique non ciblée de tumeurs du sein chez 51 patientes traitées au Centre de lutte contre le cancer de Nice entre 2013 et 2016 (cancers de stades I à IIIB) et 49 patientes traitées dans une autre institution (Centre de lutte contre le cancer de Dijon) entre 2007 et 2012 (cancers de stades IIA à IV). La première série de patientes a servi à créer une base de données « d'entrainement », pour disposer d'un modèle discriminant, et la deuxième série a fourni des données « de validation ». Les auteurs ont identifié une signature métabolomique pour les tumeurs invasives de haut grade avec des AUC de 0,88, soit une probabilité de près de 90 % de capacité à discriminer des tumeurs de haut grade versus des tumeurs de plus bas grade. Ils ont ainsi identifié plusieurs biomarqueurs de l'agressivité tumorale, tels que la N1,N12-diacétylspermine et les catabolites issus du métabolisme du tryptophane, tous deux impliqués dans l'inhibition de la réponse immunitaire.
Ce travail fournit de nouvelles informations sur les mécanismes biologiques qui sous-tendent l'agressivité des tumeurs du sein. Les biomarqueurs identifiés devraient permettre de développer de nouvelles stratégies pour une meilleure stratification des patientes dans les différents essais cliniques d'immunothérapie, et, à terme, d'obtenir une prise en charge personnalisée.
Contacts : Thierry Pourcher (thierry.pourcher@cea.fr ou thierry.pourcher@univ-cotedazur.fr) ou Caroline Bailleux (caroline.bailleux@nice.unicancer.fr)
- Le grade de Scarff-Bloom Richardson (SBR) correspond à une classification histopronostique des cancers du sein en trois grades de malignité, basée sur le degré de différenciation de la tumeur, ses atypies nucléaires et son activité mitotique.
- La métabolomique est la science des métabolites, composés de petite taille (en général moins d'un kilodalton) formés au cours du métabolisme, qu'il s'agisse des produits terminaux ou d'intermédiaires. La métabolomique ciblée vise à identifier une voie ou un métabolite d'intérêt sur la base d'une relation préalablement identifiée. L'approche non ciblée vise à identifier et à quantifier le plus grand nombre possible de métabolites dans un échantillon.
- Le modèle probabiliste choisi est l'aire sous la courbe, Area Under the Curve (AUC) qui peut être interprétée comme la probabilité que, parmi deux sujets choisis au hasard, par exemple, un malade et un non-malade, la valeur du marqueur soit plus élevée pour le malade que pour le non-malade. Ainsi, l'augmentation de l'AUC indique une amélioration des capacités discriminatoires, avec un maximum de 1,0 (100%).