Qu'est ce que PEPS ?

• Les biomarqueurs jouent un rôle essentiel dans la détection et la surveillance des pathologies, ainsi que dans l’évaluation de l’efficacité des traitements. À l’heure actuelle, les échantillons sanguins destinés à l’analyse protéomique par spectrométrie de masse se préparent manuellement. Afin de gagner du temps et d’éviter les erreurs humaines, le CEA-Leti, en partenariat avec Clinatec et le CEA-Irig, a conçu un laboratoire microfluidique miniaturisé et transportable, baptisé PEPS, qui effectue automatiquement toutes les étapes nécessaires à la préparation de tous types de biomarqueurs, de l’extraction du plasma à la purification des peptides.
  

• Le sang doit être manipulé avec précaution en protéomique. Le système PEPS pilote une cartouche microfluidique pour réaliser les étapes fluidiques de façon entièrement automatisée et contrôler la température des échantillons sanguins.
  

• PEPS réalise toutes les étapes complexes de préparation d’échantillon en protéomique en moins de 2 h (contre 24 h manuellement). Cela inclut l’injection du sang total prélevé au chevet du patient, la séparation et la calibration en volume du plasma, la déplétion en protéines abondantes, la digestion des protéines par la trypsine et la stabilisation des peptides sur une phase solide.
  

 Application

• PEPS permet de réaliser des essais cliniques à grande échelle en utilisant la protéomique basée sur la spectrométrie de masse et l'évaluation de la biothérapie.
  

  
  

   Nouveauté?
  

  PEPS est un dispositif microfluidique très fiable et robuste qui traite rapidement des échantillons de sang au chevet du patient, permettant des analyses protéomiques standardisées basées sur la spectrométrie de masse (MS).
  

  PEPS comprend :

  • Un équipement électromécanique réutilisable qui contrôle avec précision tous les paramètres de préparation (pression, volumes, température, etc.) ;
    
  • Une cartouche microfluidique à usage unique spécialement conçue avec des réactifs lyophilisés, des valves et des filtres embarqués, ainsi qu’une colonne chromatographique intégrée ;
    
  • Plus de 14 étapes de préparation d’échantillons intégrées sur une seule cartouche ;
    
  • Processus entièrement automatisé ;
    

  • Réalisation de toutes les étapes complexes : manipulation sure de l’échantillon sanguin, filtration facile, mélange rapide, dilution exacte, contrôle de la température précis ;

  • Délai de traitement réduit à 2 h contre 24 à 48 h lorsqu’il est réalisé manuellement.
    

  
  

   Prochaine étape?

  Cette technologie est en cours d'évaluation pour différentes applications par des partenaires industriels.