Cet ouvrage présente des méthodes modernes et améliorées qui détaillent les techniques permettant d'effectuer des analyses protéomiques dédiées à la découverte de biomarqueurs pour la santé humaine. Les chapitres guident les lecteurs à travers les facteurs pré / post-analytiques, les protocoles de préparation des vésicules extracellulaires et des exosomes, ainsi que divers axes d'analyse comprenant l'acquisition de données indépendantes (DIA), la découverte, ainsi que des workflows d'analyse protéomique ciblés et descendants. Des outils bioinformatiques et des workflows pour sélectionner et évaluer des biomarqueurs ou des combinaisons de biomarqueurs candidats sont également présentés. Rédigés dans le format très populaire de la série
Methods in Molecular Biology, les chapitres comprennent des introductions à leurs sujets respectifs, des listes de matériels et des réactifs nécessaires, des protocoles de laboratoire étape par étape, facilement reproductibles, ainsi que des conseils pour résoudre les problèmes et éviter les pièges connus. Proteomics for Biomarker Discovery:
Methods and Protocols, faisant autorité et à la pointe de la technologie, vise à garantir le succès des recherches ultérieures menées dans ce domaine vital.
.........Table des matières........
Pre- and Post-analytical Factors in Biomarker Discovery - Klont, Frank (et al.)
Pre-fractionation of Noncirculating Biological Fluids to Improve Discovery of Clinically Relevant Protein Biomarkers - Farina, Annarita
Serum Exosome Isolation by Size-Exclusion Chromatography for the Discovery and Validation of Preeclampsia-Associated Biomarkers - Navajas, Rosana (et al.)
Protein Biomarker Discovery Using Human Blood Plasma Microparticles - Taleb, Raghda Saad Zaghloul (et al.)
A Standardized and Reproducible Proteomics Protocol for Bottom-Up Quantitative Analysis of Protein Samples Using SP3 and Mass Spectrometry - Hughes, Christopher S. (et al.)
Analyzing Cerebrospinal Fluid Proteomes to Characterize Central Nervous System Disorders: A Highly Automated Mass Spectrometry-Based Pipeline for Biomarker Discovery - Núñez Galindo, Antonio (et al.)
Lys-C/Trypsin Tandem-Digestion Protocol for Gel-Free Proteomic Analysis of Colon Biopsies - Schniers, Armin (et al.)
Tube-Gel: A Fast and Effective Sample Preparation Method for High-Throughput Quantitative Proteomics - Muller, Leslie (et al.)
Protein Biomarker Discovery in Non-depleted Serum by Spectral Library-Based Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry - Kraut, Alexandra (et al.)
Discovering Protein Biomarkers from Clinical Peripheral Blood Mononuclear Cells Using Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry - Ku, Xin (et al.)
Intact Protein Analysis by LC-MS for Characterizing Biomarkers in Cerebrospinal Fluid - Vialaret, Jérôme (et al.)
Detection of Proteoforms Using Top-Down Mass Spectrometry and Diagnostic Ions - Coelho Graça, Didia (et al.)
Development of a Highly Multiplexed SRM Assay for Biomarker Discovery in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Tissues -Steiner, Carine (et al.)
Development and Validation of Multiple Reaction Monitoring (MRM) Assays for Clinical Applications - Kontostathi, Georgia (et al.)
Protein-Level Statistical Analysis of Quantitative Label-Free Proteomics Data with ProStaR - Wieczorek, Samuel (et al.)
Computation and Selection of Optimal Biomarker Combinations by Integrative ROC Analysis Using CombiROC - Bombaci, Mauro (et al.)
PanelomiX for the Combination of Biomarkers - Robin, Xavier
Designing an In Silico Strategy to Select Tissue-Leakage Biomarkers Using the Galaxy Framework - Nguyen, Lien (et al.)