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Chemogénomique, des petites molécules pour explorer le vivant


​​​​​​​​​​​​​Une introduction à l’usage des biologistes, chimistes et informaticiens. Édité par Éric Maréchal, Sylvaine Roy et Laurence Lafanechère. EDP Sciences, Collection Grenoble Sciences, 2007, 258 pages.

Publié le 10 juin 2007



Édition : EDP Sciences, Collection Grenoble Sciences
ISBN 978 2 7598 0005 6
258 pages


Une introduction à l’usage des biologistes, chimistes et informaticiens.

PARTIE I : Le criblage pharmacologique automatisé.
Chapitres 1 à 7

PARTIE II : Le criblage à haut contenu d’information et les stratégies de génétique chimique.
Chapitres 8 à 10

PARTIE III : Vers une exploration in silico des espaces chimique et biologique.
Chapitres 11 à 16

.........Plan détaillé.........

Jean Cros
Préface.
 page 1

André Tartar
Introduction.
pages 03-04

Chapitre 1
Éric Maréchal, Sylvaine Roy & Laurence Lafanechère
Le processus de criblage pharmacologique : la petite molécule, la cible biologique, l’automate, le signal et l’information.
 pages 07-21

Chapitre 2
Marcel Hibert
Les collections de molécules pour le criblage : exemple de la Chimiothèque Nationale.
 pages 23-28

Chapitre 3
Martine Knibiehler
L'essai biologique miniaturisé : contraintes et limites.
 pages 29-43

Chapitre 4
Samuel Wieczorek
Le signal : aspects statistiques, normalisation, analyse élémentaire.
 pages 45-55

Chapitre 5
Éric Maréchal
La mesure de la bio-activité : Ki, IC50 et EC50.
 pages 57-67

Chapitre 6
Sylvaine Roy
La modélisation du criblage pharmacologique : maîtrise des processus et des informations chimiques, biologiques et expérimentales.
 pages 69-80

Chapitre 7
Caroline Barette
La démarche qualité pour le criblage automatisé.
 pages 81-87

Chapitre 8
Laurence Lafanechère
Le criblage phénotypique sur cellules et les stratégies de génétique chimique directe.
pages 91-107		Chapitre 9
Benoît Déprez
Le criblage à haut contenu d’information pour la génétique chimique directe (criblage phénotypique sur organismes) et inverse (criblage structural par RMN).
 pages 109-119

Chapitre 10
Yung-Sing Wong
Quelques principes sur la Synthèse Orientée vers la Diversité.
pages 121-139

Chapitre 11
Samia Aci
Descripteurs moléculaires et indices de similarité.
pages 143-159

Chapitre 12
Gérard Grassy & Alain Chavanieu
La lipophilie des molécules : un descripteur prépondérant pour la QSAR.
pages 161-180

Chapitre 13
Dragos Horvath
L’annotation et la classification de l’espace chimique pour la chemogénomique.
pages 181-194

Chapitre 14
Jordi Mestres
L’annotation et la classification de l’espace biologique pour la chemogénomique.
pages 195-206

Chapitre 15
Gilles Bisson
Apprentissage artificiel et données de criblage.
pages 207-223

Chapitre 16
Didier Rognan
Le criblage virtuel par docking moléculaire.
pages 225-236

 Glossaire
pages 237-250
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