Le virus influenza A, un pathogène respiratoire extrêmement contagieux, représente une menace mondiale importante en raison de sa capacité de réassortiment génétique. Son génome, segmenté, code entre autres pour la nucléoprotéine (NP), une protéine clé du virus chargée d’encapsider le génome viral au sein des complexes ribonucléoprotéiques (RNP). Cette encapsidation est cruciale pour la réplication virale et la protection du génome du virus. Notre compréhension de la structure de la RNP est limitée en raison de données structurales à basse résolution. L’objectif de mon projet était d’améliorer notre compréhension de cet assemblage et de proposer un modèle d’encapsidation du génome viral en utilisant des particules recombinantes de type nucléocapside (RNP-like) reconstituées in vitro. Durant ma thèse, ces RNP-like ont été caractérisées par divers méthodes structurales, révélant de nouveaux détails de l’interaction NP-ARN grâce à une première structure à résolution sous-nanométrique obtenue par cryo-microscopie électronique. À la suite de ces résultats novateurs, plusieurs autres structures à haute résolution ont été obtenues, marquant une avancée considérable dans ce domaine. En effet, elles permettent de caractériser en détail le complexe NP-ARN dans diverses conformations et révèlent précisément les réseaux d’interaction NP-NP et NP-ARN. Cela nous a permis de proposer un modèle d’encapsidation qui repose sur les données obtenues des intermédiaires d’encapsidation NP-ARN. Ces découvertes apportent des détails sans précédent sur l’encapsidation du génome et pourront contribuer au développement de stratégies antivirales innovantes ciblant les RNPs du virus de la grippe.​
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